CHIP-seq+RNA-seq+脂质组联合分析揭示鳞状细胞癌的转录失调机制
鳞状细胞癌(SCCs)是一种来自多个器官的层状鳞状上皮的恶性肿瘤,其中食道(ESCC)和肺(LUSC)是最致命的,几乎没有有效的治疗靶点。TP63作为主要转录因子(TFs)之一,在正常鳞状细胞分化和鳞状细胞癌的发育中都起着重要作用。作者通过表观基因组学、代谢组学和转录组学分析,阐明了鳞状癌细胞中固醇调节元件结合转录因子1(SREBF1)作为连接TP63与脂肪酸代谢的核心媒介,起到调节脂肪酸、鞘磷脂(SL)和甘油磷脂(GPL)生物合成的作用。此外,作者还发现SREBF1与TP63/KLF5相互协作,调控SCC表观基因组中的数百个顺式调控元件,这些元件汇聚在一起从而激活促癌通路,揭示了SREBF1可作为SCC潜在的治疗靶点和预后标志物。···