宏基因组测序助力猪肠道微生物基因组的构建
作者利用本研究中进行宏基因组测序的500个样本以及数据库中的287个猪肠道宏基因组数据,建立了猪肠道微生物组的基因目录(PIGC),覆盖了1724万个90%同源蛋白,构建了6339个微生物基因组。通过Binning分箱,获得了6339个宏基因组组装基因组(MAGs),聚类到2673个种水平基因组分箱中(SGBs),其中86%(2309个SGBs)根据现有数据库是未知的。利用目前的基因目录和MAGs,作者发现野猪和杜洛克猪肠道微生物群之间在菌株水平存在明显差异,这主要得益于基因组的完善。因此,通过宏基因组测序及Binning分箱构建的PIGC和MAGs为猪肠道微生物群相关的研究提供了广泛的资源。···